Anayasa Mahkemesi 1. Bölümü, 25 Mart'ta yaptığı toplantıda aldığı kararda, Üçok'un 2009'da Hava Kuvvetleri Komutanlığı askeri savcısı (başsavcı) olduğu dönemde Kayseri'de Fethullah Gülen grubu olarak bilinen oluşumla ilgili bir soruşturma yürüttüğü belirtildi.
Üçok'un, Hava Kuvvetleri Komutanlığının elektronik yazışma sistemine girdikleri ve bazı TSK personelini "Ergenekon" örgütü üyesi göstermek amacıyla sahte emirler ürettikleri iddiasıyla 3 astsubay hakkında soruşturma açtığı ifade edilen kararda, astsubayların Gülen grubunun TSK'daki örgütlenmesi hakkında oldukça ayrıntılı itiraflarda bulunduğu ve daha sonra bu kişilerin tutuklandığı anlatıldı.
Astsubayların tutuklanmasından yaklaşık 9 ay sonra Ahmet Zeki Üçok'un, söz konusu soruşturma sırasında astsubaylara işkence yapmakla suçlandığı ve suçlamalar nedeniyle tutuklandığı aktarılan kararda, şunlar kaydedildi:
"Kayseri 2. Ağır Ceza Mahkemesi 17 Nisan 2012'de Ahmet Zeki Üçok'un işkence suçundan toplam 7 yıl 6 ay hapis cezası ile cezalandırılmasına karar vermiş ve karar Yargıtay 8. Ceza Dairesince 13 Aralık 2012'de onanmıştı.
Anayasa Mahkemesi Birinci Bölümü, 25 Mart 2015'te yaptığı toplantıda, başvurucu Ahmet Zeki Üçok'un astsubayların gözaltında bulunduğu sırada muayenelerini yapan doktorların, müştekilerin müdafiliklerini yapan avukatların ve soruşturmada görev alan askeri personelle diğer personelin tanık olarak dinlenmeleri ve nezarethane koşullarının tespiti için keşif yapılması taleplerinin reddedilmesi nedeniyle silahların eşitliği ilkesi ile savunma tanıklarının davet edilmelerinin ve dinlenmelerinin sağlanması hakkına uygun davranılmamış olması nedeniyle adil yargılanma hakkının ihlal edildiğine karar vermiştir."
