Başbakanlık kaynaklarından alınan bilgiye göre, 1960 yılında Trabzon'da doğan Musa, orta ve yüksek okul eğitimini yurt dışında devam ettirdi. Musa, Yüksek öğrenimini 1987 yılında Nancy II Üniversitesi, Hukuk, İktisat ve İşletme Fakültesi, Siyasi İktisat Bölümü'nde tamamladı.
Yüksek lisans (1988) ve doktora (2001-2008) derecelerini aynı üniversitede alan Musa'nın, tez konusu "Sosyal Haklar ve AB'nin Anayasallaşma Süreci" üzerine iken, doktorası ise "Kamu Hukuku/Topluluk Hukuku" alanındaydı.
Eski Brüksel Büyükelçisi olan ve meslek hayatında birçok önemli görevi yürüten Musa, Tataristan Cumhuriyeti'nin başkenti Kazan'ın 1000. kuruluş yıl dönümü etkinlikleri çerçevesinde de onur madalyasına layık görüldü.
MİT Müsteşar Vekilliği görevine atanan Musa, kurumda Dış İstihbarattan Sorumlu Müsteşar Yardımcılığı görevini yürütüyordu.
Evli ve iki çocuk babası olan İsmail Hakkı Musa, Fransızca ve İngilizce biliyor.