Fenerbahçe formasıyla 2008 yazında 22 yaşında tanışan Gökhan, toplam 338 resmi maça çıktı.
AA'nın haberine göre; Fenerbahçe, takım kaptanlığına kadar yükselen Gökhan'ın bonservisini 2008 yılında gelecek vadeden oyuncu olarak Gençlerbirliği'nden aldı. Daha önce kiralık olarak Gençlerbirliği OFTAŞ'la alt liglerde oynayan Gökhan, Fenerbahçe formasıyla tanıştığı Süper Lig'de 254 kez mücadele etti.
Bütün Süper Lig maçlarını Fenerbahçe'yle oynayan Gökhan, bu kulvarda 10 kez gol atmayı başardı.
Forma giydiği 9 sezonda Fenerbahçe'nin vazgeçilmezi olan başarılı futbolcu, sarı-lacivertlilerle 28 Türkiye Kupası, 54 Avrupa kupaları, 2 kez de TFF Süper Kupa'da oynadı. Gökhan, Türkiye Kupası'nda 2 kez gol attı.
9 SEZONDA 6 KUPA
Gökhan Gönül, Fenerbahçe'yle geçirdiği 9 sezonda 6 kupa kazandı.
Süper Lig'de 2010-2011 ve 2013-2014 sezonlarında şampiyonluk sevinci yaşayan Gökhan, 2011-2012 ile 2012-2013 sezonlarında ise Türkiye Kupası'nı havaya kaldırdı.
Gökhan, TFF Süper Kupa sevincini ise sarı-lacivertli formayla 2009 ve 2014 yıllarında yaşadı.
Milli futbolcu Avrupa kupalarından da kulüp tarihinin en önemli başarılarını yaşamasına da yardımcı oldu. İlk sezonunda Fenerbahçe'yle UEFA Şampiyonlar Ligi'nde çeyrek final oynayan Gökhan, 2012-2013 sezonunda da UEFA Avrupa Ligi'nde yarı final heyecanını tattı.
