Sarı-siyahlı ekip 2009-2010 sezonunda düştüğü Spor Toto 3. Lig'de 5 sezonluk mücadelesinin ardından, 2015-2016 sezonunda Spor Toto 2. Lig'de yer almaya hak kazandı.
Ligde 1. Grup'ta 34 haftalık normal sezonu 61 puanla 4. sırada tamamlayarak play-off'a katılma hakkını elde eden İstanbulspor, yarı final turunda Zonguldak Kömürspor'u iç sahada 0-0, deplasmanda ise 1-1 beraberliklerle eleyerek finale yükselmişti.
