Spor Toto 2. Lig ve Spor Toto 3. Lig'de 2012-2013 sezonu grup kura çekimi Ankara Marriott Otel'de yapıldı. Kura çekiminde TFF yöneticilerinin yanı sıra kulüplerin temsilcileri de hazır bulundu.
2012 - 2013 sezonunda Spor Toto 2. Lig 2 grupta, Spor Toto 3. Lig ise 3 grupta oynanacak. Gruplar belli olurken, fikstür çekimi ise ileri bir tarihte yapılacak.
Spor Toto 2. Lig Kırmızı ve Beyaz Grup takımları şöyle:
KIRMIZI GRUP
Tarsus İdman Yurdu
Bugsaş Spor
Çankırıspor
Fethiyespor
Bandırmaspor
Bozüyükspor
Kahramanmaraşspor A. Ş.
Giresunspor
Nazilli Belediyespor
Hatayspor
Sarıyer
İstanbul Güngörenspor
Tepecikspor A. Ş.
Pendikspor
Turgutluspor
Ünyespor
Sakaryaspor A. Ş.
BEYAZ GRUP
Konya Torku Şekerspor
Kızılcahamamspor A. Ş.
Beypazarı Şekerspor
Alanyaspor
Balıkesirspor
İnegölspor
Yeni Malatyaspor
Ofspor
Denizli Belediyespor
İskenderun D. Ç Spor
Bayrampaşaspor
Gaziosmanpaşaspor
Eyüpspor
Kırklarelispor
Altay
Tokatspor
Körfez Futbol Kulübü