Raporda, ele geçirilen belgelerin yer darlığı nedeniyle döşeme altına konduğu şeklindeki ifadeye yer verilmişti. Bu iddianın doğru olmadığı belirtildi. Aramalara katılan askerlerin döşeme altından belge çıkmasına şaşırdıkları ve buranın arşiv olarak kullanıldığına dair herhangi bir bilgiyi savcıya vermedikleri belirtildi. Öte yandan Cumhuriyet Gazetesi'nin aramada ele geçen dört CD'nin imajına askerlerin imza atmadığı iddia edilmişti. Bu iddia da yalanlandı.
Gölcük'te bulunan belgelerle ilgili Donanma Komutanlığı tarafından yürütülen soruşturma kapsamında askeri bilirkişi rapor hazırlanmıştı. Raporda, aynı zamanda İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı'nca yürütülen "askeri casusluk ve şantaj" soruşturmasında tutuklu olan Astsubay Erdinç Yıldız'ın 'Oraj' ve 'Suga' planlarıyla ilgili bilgilerin de bulunduğu hard diskleri yer darlığı nedeniyle döşeme altına koyduklarını ifade ettiği belirtilmişti. Ancak 6 Aralık 2010'da yapılan arama sırasında savcılara bu yönde herhangi bir bilgi verilmediği öğrenildi. Arama yapan askerlerin belgelerin döşeme altından çıkmasına şaşırdıkları da ifade edildi. Aramalarda istihbarat bölümündeki tüm parkelerin altının arandığı bilgisine de ulaşıldı.
Öte yandan Cumhuriyet Gazetesi'nin bugünkü haberinde, "Askerler arama sırasında ortaya çıkan ve içinde ne olduğu kimse tarafından bilinmeyen 4 CD'nin kendilerine ait olmadığını belirterek CD'ler ile ilgili el koyma tutanağını imzalamadı. 5 hard diskin tutanağını imzalayarak imajını alan askerler 4 CD'nin imajını almadı." iddiasına yer verilmişti. Bu iddiaların da doğru olmadığı ortaya çıktı. Soruşturma konusu CD'lere askerler tarafından hiçbir itirazi kaydın düşülmediği belirtildi. Aramada ele geçen tüm belgeler için de tutanak tutulduğu ifade edildi.
