YÖK, 2009 yılında en çok bilimsel yayın yapan üniversiteler ile öğretim üyesi başına düşen yayın oranlarını belirledi. 2008 yılında olduğu gibi 2009'da da bilimsel yayın sıralamasında İstanbul Üniversitesi (İÜ) ilk sırada bulunuyor. Öğretim üyesi başına düşen yayın oranında 2009'un lideri Ardahan Üniversitesi oldu. 'Tam makale'ler dikkate alınarak yapılan sıralamaya 125 üniversite dahil edildi. Bu üniversiteler toplam 25 bin 46 bilimsel yayın yaptı.
Üniversitelerdeki bilimsel yayın sayıları sıralamasında İstanbul Üniversitesi bin 338 bilimsel yayın ile ilk sırada yer alırken, bunu bin 182 yayın ile Hacettepe Üniversitesi ve bin 170 yayın ile Ankara Üniversitesi izledi.
Öğretim üyesi başına düşen yayın sayısında ise birinci sırada 5.0 ortalama ile Ardahan Üniversitesi, ikinci sırada 2.30 ortalama ile Adıyaman Üniversitesi, üçüncü sırada ise 1.78 ortalama ile Aksaray Üniversitesi bulunuyor.
Bilimsel yayın sayılarına göre yapılan sıralamada, hiç yayını bulunmayan üniversiteler arasında Mardin Artuklu Üniversitesi ile Şırnak Üniversitesi yer alıyor.
Yalova Üniversitesi 1, Hakkari, Iğdır, İstanbul Arel, Karamanoğlu Mehmet Bey üniversiteleri 2, Bayburt, Bitlis Eren, Mimar Sinan üniversiteleri 3 bilimsel yayına sahip.
Batman Üniversitesi ise bilimsel yayın oranıyla Türkiye'de 5'inci sırada 1.63'lük oranla yerini aldı.
2009 yılında ilk 10 sırada yer alan üniversitelerin öğretim üyesi başına düşen yayın oranları ise şöyle:
ÜNİVERSİTE ADI BİLİMSEL YAYIN ORANI
1. Ardahan Üniversitesi 5.00
2. Adıyaman Üniversitesi 2.30
3. Aksaray Üniversitesi 1.78
4. Tunceli Üniversitesi 1.67
5. Batman Üniversitesi 1.63
6. Bingöl Üniversitesi 1.42
7. Karabük Üniversitesi 1.33
8. TOBB ETÜ 1.29
9. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi 1.20
10. Rize Üniversitesi 1.18.
