Emekli Hakim Albay Atpulat, açığa alınan generallerin talebini reddeden AYİM'den bu sonucu beklemediğini de söyledi. Atpulat, "Generaller açığa alındığına göre 30 Ağustos'tan itibaren emekli edilmeleri gerekir. Açığa alınmadan önce görevde olmaları da tartışılırdı. AYİM'in son kararından sonra hukuken emekli oldular. Bunun için kararnameye bile gerek yok." şeklinde konuştu.
Balyoz sanıkları arasında bulunan Tümgeneral Gürbüz Kaya, Tümgeneral Halil Helvacıoğlu ve Tuğamiral Abdullah Gavremoğlu, bu seneki YAŞ'ta terfi ettirilmedi. Bunun üzerine AYİM'e başvurarak, yürütmenin durdurulmasını talep ettiler. AYİM'in yürütmeyi durdurma kararı vermesi üzerine Başbakanlık itiraz etti. AYİM, itirazı reddederek üç generale terfi yolunu açtı. Millî Savunma Bakanı Vecdi Gönül 22 Kasım 2010'da Tümgeneral Kaya ve Tuğamiral Gavremoğlu'nu, İçişleri Bakanı Beşir Atalay ise bir gün sonra Tümgeneral Helvacıoğlu'nu açığa aldı. Bakanlar, 926 Sayılı Türk Silahlı Kuvvetleri Personel Kanunu'nun, açığa alınan veya tutuklanan subay ve askerî memurlar hakkındaki esasları içeren 65. maddesinin kendilerine verdiği yetkiyi kullandı. Kaya, Gavremoğlu ve Helvacıoğlu, bir gün sonra açığa alınma işleminin yürütmesinin durdurulması ve iptali talebiyle AYİM'e başvurdu. Konuyu Daireler Kurulu'nda değerlendiren AYİM, talebi oy çokluğuyla reddetti.