Ergenekon soruşturması kapsamında tutuklandıktan sonra cezaevine gittiği gün hastaneye kaldırılan Mehmet Haberal'ın mahkemeden gizlenen sağlık raporu ile ilgili soruşturma kapsamında ilk olarak raporu hazırlayan 5 kişilik heyet ifadeye çağrılacak. Ergenekon soruşturması savcılarından Fikret Seçen tarafından yürütülen soruşturma kapsamında 16 Ekim 2009'da verilen raporda imzası bulunan İstanbul Üniversitesi Çapa Tıp Fakültesi Kardiyoloji Anabilim Dalı Başkanı Prof. Dr. Zerrin Yiğit, Kurul üyeleri olarak Prof. Dr. Cengiz Çeliker, Prof. Dr. Vedat Sansoy, Prof. Dr. Tevfik Gürmen ve Dr. Cengizhan Türkoğlu için yarın tebligat yazılacağı öğrenildi.
17 Nisan 2009 tarihinde tutuklanan Haberal, 'ani ölüm riski altında olduğu' gerekçesiyle tahliye kararı vermeyen dokuz hakimi tazminat ödemeye mahkum ettirmişti. Bu karardan sonra 16 Ekim 2009 tarihinde hazırlanan bir raporda, Haberal'ın taburcu edilebileceğinin belirtildiği ortaya çıkmıştı. Söz konusu raporda, "Enstitümüzün 3. Servisinde 304 numaralı odada yatmakta olan hasta Mehmet Haberal'ın sağlık durumu değerlendirilmiş ve tıbbi tedavisine ayaktan devam edilerek, bir ay sonra kontrole gelmek üzere taburcu edilmesine karar verilmiştir." deniliyor.
Ergenekon davasına bakan İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi de raporun saklandığına dair haberler üzerine söz konusu raporu istemiş ve Haberal'ın Adli Tıp Kurumu'na sevk edilmesine karar vermişti. Mahkeme ayrıca bu raporla ilgili tüm evrakların İstanbul Cumhuriyet Başsavcı Vekilliği'ne gönderilerek gereğinin yapılmasını kararlaştırmıştı. Bu gelişme üzerine savcı Seçen, raporun gizlenmesinde sorumluluğu olan şahıslar hakkında 'Ergenekon terör örgütüne yardım etmek' suçundan soruşturma açmıştı.
