İkinci etap çalışmalar çerçevesinde Ankara'dan İzmir'e geliş güzergâhı olan Ankara Caddesi ile yan yolunun, Osman Kibar Kavşağı tüneli girişine yaklaşık 100 metre kala yapılacak raylı sistem dikine geçiş çalışmaları sırasında trafik akışı İzmir yönüne doğru iki, Ankara yönüne doğru üç şerit olacak. Bu üç şeridin biri yan yol, ikisi Ankara Caddesi olarak kullanılacak.
İzmir yönünden Uşak-Ankara yönüne geçiş yapacak araçların güzergâhında herhangi bir değişiklik yapılmadı. Burayı kullanacak ağır tonajlı araçlar ise Ege Üniversitesi Kavşağı'ndan otoyola yönlendirilecek.
Uşak-Ankara yönünden İzmir yönüne geçiş yapacak araçların güzergâhında da değişiklik olmayacak. 121 Sokak, Ankara Caddesi'nden giriş yapılacak şekilde Evka-3 Tansaş sinyalize kavşağına kadar tek yönlü düzenlenecek. 1. etap çalışmaları sırasında tek yön olarak düzenlenen Cengizhan Caddesi ise (eski 119 Sokak), 2. etap çalışmaları sırasında çift yön olarak çalışacak.
Manisa-İstanbul yönünden Uşak-Ankara yönüne geçiş yapacak araçlar İstanbul Caddesi-Topçu Tugayı Kavşağı-Hasan Ali Yücel Caddesi-Cengizhan Caddesi-129/13 Sokak ve 129 Sokak üzerinden ulaşım sağlayacak.