Aydemir, zorunlu askerliği reddettiği için ilk olarak 31 Temmuz 2007 tarihinde
tutuklanmıştı. Yaklaşık iki ay cezaevinde kalan Aydemir yapılan ikinci duruşmada iki gün içinde birliğine teslim olması istenerek tahliye edilmişti. Ancak Aydemir, birliğine teslim olmayınca asker kaçağı olduğu gerekçesiyle yine tutuklandı.
Türkiye'de daha çok savaş, karşıtlığı veya politik nedenlerle askerlik reddedilirken ilk defa Aydemir, İslami inançlarını ileri sürerek askere gitmeyi
reddetti. Aydemir, laik, Kemalist değerlere dayanan ordunun dini inançlarına aykırı olduğunu belirterek, görev yapmak istemediğini belirtti.
'SAYGI DUYULMALI'
İslamcı çevreler, Aydemir'in kararının daha çok imani nedenlerden olduğunu
söyleyerek, onun için vicdani retçiden çok "imani" ya da "İslami ret" kavramının
kullanılmasının daha doğru olduğunu söylüyor. Mazlum Der, Aydemir'in dini nedenlerden dolayı askerlik görevini reddeden ilk kişi olduğunu söylerken,
İlim ve Kültürel Araştırmalar Vakfı iman gerekçesiyle askerlik yapmayı reddedenlerin bu kararına saygı duyulmasını istedi.