2008 yılının Nisan ayında yapılan seçimlerde 60 yıldır Paraguay'ı demir yumrukla yöneten Colorado Partisi'nin adayını yenilgiye uğratarak devlet başkanı seçilen "yoksulların papazı" lakaplı Fernando Lugo'nun hükümetinin aldığı kararla 25 Aralık tarihi itibariyle tüm ülkede ücretsiz sağlık hizmetinin ikinci aşaması uygulanmaya başlandı.
Lugo hükümetinin sağlık sistemini aşamalı biçimde ücretsiz hale getirmesinin ilk adımı, Lugo'nun göreve gelmesinin ardından atılmış ve bütün sağlık birimlerinde teşhis hizmeti ücretsiz hale getirilmişti. İkinci adımda ise tedavi hizmetlerinin ücretsiz olarak sağlanması öngörülüyor. Lugo hükümeti bir sonraki adımda ilacı ücretsiz hale getirmeyi planlıyor.
Sağlık altyapısı çok kötü olan Paraguay'da hükümet, başta Venezüella'daki olmak üzere uygulanan sağlık reformlarını da değerlendirmeye almış durumda. Lugo hükümeti uzun vadeli bir plan dâhilinde sağlık altyapısını geliştirmeyi, birinci kademe sağlık birimlerini yaygınlaştırmayı ve bütün sağlık hizmetini ücretsiz hale getirmeyi planlıyor.