İspanya Gol Kralı titriyle geçen sezon geldiği sarı-lacivertli ekipte beklenen başarıyı sergileyemeyen Güiza, 2009-2010 sezonuna oldukça hızlı başladı.
İlk sezonunda son haftalarda açıldığı Turkcell Süper Lig'de 11, Avrupa kupalarında 3 ve Fortis Türkiye Kupası maçlarında toplam 2 olmak üzere toplam 16 gol atan İspanyol futbolcu, bu sezon çıktığı 4 resmi maçta 5 gole imzasını attı.
Fenerbahçe'nin 4 resmi maçta rakiplerinin filelerine attığı 10 golün yarısını kaydeden Güiza, UEFA Avrupa Ligi 3. eleme turunun ilk maçında Honved filelerine 3, Turkcell Süper Lig'in ilk maçında da Denizlispor kalesine 2 gol bıraktı.