Denizlispor forması altında başarılı maçlar çıkaran Kratochvil, zaman zaman savunmadan çıkarak attığı gollerle Denizlispor taraftarlarına kendini sevdirdi. Yeşil-siyahlı forma altında ligde ve kupada 35 gol kaydeden Roman Kratochvil, bu süre içinde kendi kalesine de 3 gol attı. En son Denizlispor'un geçen hafta Turkcell Süper Lig'de Beşiktaş ile karşılaştığı maçta kendi kalesine gol atan Slovak oyuncu, 2003-2004 sezonunda Denizli'deki Beşiktaş ve 2006-2007 sezonundaki deplasmandaki Antalyaspor maçlarında topu kalesine göndermişti.
Teknik direktör Ümit Kayıhan'ın almak istediği iki yabancıya kontenjan açmak için Tomas Abraham ile birlikte sözleşmesi feshedilen Kratochvil, Denizlispor'un önemli bir çok maçında kurtarıcı oldu. Bir çok kulübün peşinde olduğu Kratochvil, Denizlispor'dan eski çalıştırıcısı olan Giray Bulak'ın takımı Konyaspor ile sezon sonuna kadar anlaştı.