Tarihte ilk kez bir Genelkurmay Başkanı'nı ağırlayacak Bakanlar Kurulu için özel düzenlemeye gidildi.
Kabineye terörle mücadele brifingi verecek olan Org. İlker Başbuğ toplantıda Başbakan Erdoğan'ın hemen sağında iki numaralı koltuğa oturacak. Fiziki şartları daha uygun olduğu için toplantı Başbakanlık yeni binada yapılacak. Özel gündemli bu toplantının ana temasını Bayraktepe olayı, terör örgütünün son durumu ve Genelkurmay'ın bu konuda yürüttüğü soruşturma oluşturacak.
8 Mayıs 2008 tarihinde yapılan değişiklikle Cumhurbaşkanı tarafından uygun bulunan Başkent protokol listesine göre Başbakan'dan sonra gelen Genelkurmay Bakanı'na, Bakanlar Kurulu salonunda Başbakan Tayyip Erdoğan'ın hemen sağında iki numaralı koltuk ayrıldı. Genelkurmay Başkanı'nın oturacağı bölüme 'Orgeneral İlker Başbuğ' isimliği hazırlandı. Genelkurmay 2. Başkan Orgeneral Hasan Iğsız da protokol sırasına göre masadaki yerini alacak.
Toplantı teknik alt yapısı daha uygun olduğu için Başbakanlık merkez bina yerine Başbakanlık yeni binada yapılacak.