Beemelmans'ın müsteşarlığı dönemde, "Eurofighter" savaş uçağı ile ilgili savunma sanayii şirketi MTU'ya, 55 milyon avro değerinde tazminat ödenmesine Federal Meclis'in (Bundestag) onayı olmadan izin verdiği ortaya çıkmıştı. Almanya'da 25 milyon avro üzerindeki harcamalarda Federal Meclis'in onayı gerektiği öğrenildi.
Beemelmans'ın ayrıca görev yaptığı dönemde, 15 büyük savunma sanayii projesinde maliyetin artmasını ve önemli projelerdeki gecikme konularında mantıklı bir izahat yapamaması eleştirilere neden olmuştu.
Bakanlığa yakın kaynaklar, tüm bu olumsuz nedenler dolayısıyla Ursula von der Leyen'in müsteşarı görevden aldığını ifade ediyor. Stephane Beemelmans'ın, daha önce Savunma Bakanı olan Thomas de Maiziere yakın bir isim olduğu biliniyor.
Von der Leyen, Savunma Bakanı olarak göreve başladığında uzun yıllardır başmüsteşar olarak görev yapan Rüdiger Wolf'u da görevden almış, yerine kendisine yakın olan Gerd Hoofe'yı atamıştı.
