Gruplarında ilk iki sırayı alan Viktoria Plzen, FCSB, Arsenal, Kızılyıldız, Salzburg, Olympique Marsilya, Athletic Bilbao, Östersunds, Lazio, Nice, Real Sociedad ve Zenit, son 32 turuna yükseldi.
I Grubu'nda yer alan Atiker Konyaspor, deplasmanda Portekiz'in Vitoria Guimaraes takımıyla 1-1 berabere kaldı. Grupta üçüncü sırada yer alan yeşil-beyazlı ekip, organizasyona veda etti.
Oynanan maçlarda alınan sonuçlar ve puan durumu şöyle:
- G Grubu:
FCSB (Romanya) - Lugano (İsviçre): 1-2
Hapoel Beer-Sheva (İsrail) - Viktoria Plzen (Çekya): 0-2
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Viktoria Plzen | 6 | 4 | 0 | 2 | 13 | 8 | 5 | 12 |
| FCSB | 6 | 3 | 1 | 2 | 9 | 7 | 2 | 10 |
| Lugano | 6 | 3 | 0 | 3 | 9 | 11 | -2 | 9 |
| Hapoel Beer-Sheva | 6 | 1 | 1 | 4 | 5 | 10 | -5 | 4 |
- H Grubu:
Arsenal (İngiltere) - BATE (Belarus): 6-0
Kızılyıldız (Sırbistan) - Köln (Almanya): 1-0
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Arsenal | 6 | 4 | 1 | 1 | 14 | 4 | 10 | 13 |
| Kızılyıldız | 6 | 2 | 3 | 1 | 3 | 2 | 1 | 9 |
| Köln | 6 | 2 | 0 | 4 | 7 | 8 | -1 | 6 |
| BATE | 6 | 1 | 2 | 3 | 6 | 16 | -10 | 5 |
I Grubu:
Vitoria Guimaraes (Portekiz) - Atiker Konyaspor: 1-1
Olympique Marsilya (Fransa) - Salzburg (Avusturya): 0-0
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Salzburg | 6 | 3 | 3 | 0 | 7 | 1 | 6 | 12 |
| Olympique Marsilya | 6 | 2 | 2 | 2 | 4 | 4 | 0 | 8 |
| Atiker Konyaspor | 6 | 1 | 3 | 2 | 4 | 6 | -2 | 6 |
| Vitoria Guimaraes | 6 | 1 | 2 | 3 | 5 | 9 | -4 | 5 |
J Grubu:
Hertha Berlin (Almanya) - Östersunds (İsveç): 1-1
Zorya (Ukrayna) - Athletic Bilbao (İspanya): 0-2
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Athletic Bilbao | 6 | 3 | 2 | 1 | 8 | 5 | 3 | 11 |
| Östersunds | 6 | 3 | 2 | 1 | 8 | 4 | 4 | 11 |
| Zorya | 6 | 2 | 0 | 4 | 3 | 9 | -6 | 6 |
| Hertha Berlin | 6 | 1 | 2 | 3 | 6 | 7 | -1 | 5 |
- K Grubu:
Vitesse (Hollanda) - Nice (Fransa): 1-0
Zulte Waregem (Belçika) - Lazio (İtalya): 3-2
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Lazio | 6 | 4 | 1 | 1 | 12 | 7 | 5 | 13 |
| Nice | 6 | 3 | 0 | 3 | 12 | 7 | 5 | 9 |
| Zulte Waregem | 6 | 2 | 1 | 3 | 8 | 13 | -5 | 7 |
| Vitesse | 6 | 1 | 2 | 3 | 5 | 10 | -5 | 5 |
- L Grubu:
Real Sociedad (İspanya) - Zenit (Rusya): 1-3
Vardar (Makedonya) - Rosenborg (Norveç): 1-1
| Takımlar | O | G | B | M | A | Y | Av | P |
| Zenit | 6 | 5 | 1 | 0 | 17 | 5 | 12 | 16 |
| Real Sociedad | 6 | 4 | 0 | 2 | 16 | 6 | 10 | 12 |
| Rosenborg | 6 | 1 | 2 | 3 | 6 | 11 | -5 | 5 |
| Vardar | 6 | 0 | 1 | 5 | 3 | 20 | -17 | 1 |
