Ensar ed-Din 2012'de Tuareg kökenli Iyad Ag gali tarafından Mali'nin Timbuktu kentinde kuruldu.
Kuruluşunun ilk yıllarında El kaide ile bağlantılı olduklarını açıklasalar da daha sonra örgütten ayrıldıklarını duyurdular. Ensar ed-Din'in temel amacı Mali'ye şeriat getirmektir.
2013'ten beri BM ve ABD terör örgütleri listesinde yer alan Ensar ed-Din 2012-13'te Kuzey Mali'de bazı şehirleri ele geçirdi ve sadece ülkenin en kuzeyindeki çöl kısımlarında hakimiyet kurdu.
Suriye İç Savaşında da rol oynayan Ensar ed-Din örgütü Nusret Cephesi'yle birlikte bir çok grubun ortak ürünü olan Halep-Mellah operasyonlarına katıldı.